Theo Bộ NN&PTNT, năm 2012 có khoảng 100.700ha tôm nước lợ bị thiệt hại do dịch bệnh (trong đó hơn 91.100ha tôm sú và trên 7.000ha nuôi tôm thẻ) do hội chứng hoại tử gan tụy cấp tính (AHPNS), đốm trắng, đầu vàng… gây thiệt hại lớn về kinh tế và ảnh hưởng đến sản lượng, giá trị xuất khẩu. Sóc Trăng, Bạc Liêu, Bến Tre, Trà Vinh, Cà Mau… là những tỉnh bị thiệt hại nhiều nhất.